Lo normal cuando deja de funcionar es que la batería está empezando a degradarse, pero si no es el caso quizás haya algún fallo en el sistema. Si aún lo tienes en garantía pásate por el concesionario, aunque casi seguro que se agarrarán a que el problema está en la batería. Yo en tu caso aguantaría la batería aunque eso te haga prescindir del stop/start y seguramente cuando ya te toque el cambio recuperarás el stop/start con la batería nueva. En mi caso con 3 años y 9 meses (circulando poco en ciudad con él) de momento funciona perfectamente. En alguna ocasión puntual al entrar a la ciudad después de hacer un tramo de carretera salía el aviso de que no se cumplían las condiciones para que se activara (normalmente porque estaba haciendo una regeneración del filtro de partículas porque el mío es diesel y lleva adblue).